To‘plam nafas olish yo‘llari namunalarida 2019-nCoV yangi koronavirusining ORF1ab/N/S genlarini in vitro sifatli aniqlash uchun, shu jumladan orofaringeal tamponlar, nazofarengeal tampon, balg‘am va bir vaqtning o‘zida HV69-70 del mutatsiyalarini kiritish uchun ishlatiladi.GISAID ma'lumotlar bazasida xabar qilinganidek, Omicron variantlarining 95% dan ortig'i HV69-70 da o'chirishni o'z ichiga oladi, bu PCR tahlillarida S geni maqsadli ishlamay qolishiga (SGTF) olib kelishi mumkin.SGTF-dan Omicron-ni ekranlash uchun proksi-marker sifatida foydalanish mumkin.
Primer to'plamlar va FAM yorliqli zond 2019-nCoV ORF laboratoriya genini, 2019-nCoV N geni uchun VIC etiketli zondni, 2019-nCoV ning S geni HV69-70 del mutatsiyasi uchun ROX etiketli zondni maxsus aniqlash uchun mo'ljallangan.Sinov namunasi bilan bir vaqtda olingan inson RNase P geni nuklein ekstraktsiya jarayoni va reagent yaxlitligini tekshirish uchun ichki nazoratni ta'minlaydi.Insonning RNase P geniga qaratilgan prob CY5 bilan belgilangan.
Real-Time PCR tizimi: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;